Surveillance systématique du SRAS-CoV-2 dans les eaux usées

Surveillance systématique du SARS-CoV-2 dans les eaux usées -
Iéna, site pilote d'un projet de recherche

• Nécessité de tester de nouvelles méthodes de surveillance en cas d'infection
• La détection d'agents pathogènes dans les eaux usées est en cours de mise en œuvre
• Iéna est l'une des 20 villes participant au projet pilote financé par l'UE.

La pandémie Corona a montré les limites des méthodes de surveillance actuelles en cas d'infection. Un grand nombre de personnes a été nécessaire pour identifier les cas, les mesures d'endiguement n'ont parfois pu être mises en place que trop tard et, en période de pointe, les infections n'ont été signalées qu'avec un grand retard en raison de la surcharge des laboratoires.

C'est pourquoi des alternatives aux mesures actuelles de détection systématique des infections sont à l'étude. L'une d'entre elles est la surveillance (monitoring) basée sur les eaux usées, c'est-à-dire l'examen d'échantillons d'eaux usées pour analyser la propagation de certains agents infectieux. L'UE finance donc de telles approches. Le ministère fédéral de la Santé (BMG), le ministère fédéral de l'Environnement, de la Protection de la nature, de la Sécurité nucléaire et de la Protection des consommateurs (BMUV) et le ministère fédéral de l'Éducation et de la Recherche (BMBF) se sont associés pour un projet pilote national intitulé "ESI-CorA : surveillance systématique du SRAS- CoV-2 dans les eaux usées" (durée : novembre 2021 à mars 2023). Les deux autorités fédérales supérieures RKI et Umweltbundesamt (UBA) participent au projet en tant que partenaires. Le projet national est coordonné par le promoteur du projet, l'Institut de technologie de Karlsruhe (KIT).

Vingt villes allemandes participent au projet pilote - Iéna est l'une d'entre elles. Le service de santé y coopère avec le Zweckverband JenaWasser/Abwasser ainsi qu'avec un laboratoire d'analyse mandaté (SGS Analytics). Depuis la mi-mai 2022, des échantillons d'eaux usées sont prélevés deux fois par semaine à la station d'épuration de Kunitz. Les échantillons sont prélevés par les employés de la station d'épuration et envoyés au laboratoire d'analyse, qui effectue les analyses sur le virus du SRAS-CoV-2 et envoie les résultats au service spécialisé Santé.

Au cours du projet, il n'est pas seulement prévu d'effectuer des analyses concernant la détection du SRAS-CoV-2, mais également des tests de séquençage, au cours desquels l'Université technique de Darmstadt déterminera les variantes du virus qui circulent actuellement dans nos eaux usées. On espère ainsi obtenir des indications avec un temps d'avance sur un éventuel changement de variante virale (par ex. Omikron à Delta). Lors de séries de mesures comparables dans la région de Berchtesgaden, des changements dans les infections étaient déjà visibles 10 jours avant les chiffres officiels des cas.

Le projet financé par l'UE doit aider à mettre en œuvre et à évaluer la surveillance des eaux usées du SRAS-CoV-2 à l'échelle européenne recommandée par l'UE. La ville d'Iéna dispose ainsi d'un indicateur scientifique qui, en perspective, peut représenter un instrument précieux de gestion de la pandémie pour le travail de la cellule de crise. Grâce au monitoring systématique des eaux usées du SRAS-CoV-2, il est toujours possible d'obtenir une vue d'ensemble des virus du SRAS-CoV-2 circulant dans la population d'Iéna , même dans les phases pandémiques à faible incidence, où il est difficile de surveiller les patients symptomatiques.

Mais à l'avenir, la surveillance des eaux usées pourra également être utilisée pour détecter d'autres agents pathogènes, tels que les virus de la grippe, les poliovirus ou les agents pathogènes des maladies animales. En outre, cette méthode peut également être utilisée en perspective pour détecter et suivre l'évolution de l'apparition d'agents pathogènes résistants aux antibiotiques ou pour détecter d'autres substances dangereuses, telles que les drogues, les médicaments, les métaux lourds, etc.